الاستخدام السليم لخطوط الخلايا في الدراسات الطبية الحيوية

وتشير النتائج إلى أن استمرار استخدام RRIDs في الأدبيات العلمية سيسمح بتحسين الإبلاغ عن خطوط الخلايا والمواد البحثية الأخرى في المنشورات ، مما سيساعد بدوره جهود إعادة إنتاج المستقبل.

يتم استخدام خطوط الخلايا على نطاق واسع في العلوم البيولوجية. إن قدرتها على التكاثر إلى أجل غير مسمى تعني أن بإمكان العلماء ، من الناحية النظرية ، تكرار الدراسات السابقة والبناء على النتائج. ولكن سوء التوضيح أو سوء التعامل يمكن أن يؤدي إلى إساءة التعرف على الخلايا الخلوية الإشكالية أو تلوثها و / أو توزيعها ، الأمر الذي قد يؤثر بدوره على صحة بيانات البحث.

تشرح الكاتبة الشريكة الأولى زيليانا بابيتش ، وهي طالبة دراسات عليا في مركز البحوث في الأنظمة البيولوجية بجامعة كاليفورنيا في سان دييجو بالولايات المتحدة ، أن "RRIDs ينبغي أن تساعد في تقليل هذا الاستخدام غير السليم لخطوط الخلايا". "يمكن تضمين هذه المعرفات الفريدة في قسم الطرق في ورقة بحثية لتحديد خط الخلية ، أو الجسم المضاد ، أو الكائنات المحورة جينيا أو البرامج المستخدمة. ويمكنها تنبيه الباحثين إلى الموارد التي تشير إلى خطوط الخلايا الإشكالية ، مثل قاعدة بيانات Cellosaurus."

"إن قاعدة البيانات Cellosaurus هي أكثر مصادر المعرفة شمولاً في خطوط الخلايا" ، كما يقول Amos Bairoch ، الأستاذ في جامعة جنيف ، ورئيس المجموعة في المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية. "يتم إنشاء RRIDs لخطوط الخلايا بواسطة قاعدة البيانات الموثوقة."

وتضيف أماندا كيبز ديفيس ، رئيسة لجنة مصادقة الخطوط الدولية للخلايا (ICLAC): "خطوط الخلايا غير المعروفة هي مشكلة رئيسية في الأدبيات العلمية. إذا تم تنبيه الباحثين حول الخطأ في تحديد خط خلوي قبل نشره ، فهل سيظلون تقرير البيانات من هذا الخط الخلوي؟

في دراستهم ، استخدم الفريق خوارزمية معالجة اللغة الطبيعية للنص الألغام أقسام الطرق من حوالي مليوني ورقة علمية في PubMed الوسطى. واستخدم الباحثون الخوارزمية لتحديد الأوراق التي تضم RRIDs وتلك التي سردت خطوط الخلايا ، ثم قارنوا بين عدد المرات التي ظهرت فيها الخطوط الخلوية الخاطئة في هذين العنصرين.

وحددوا 305،161 من أسماء الخطوط الخلوية الفريدة في 150،459 مقالة ، وقدرت نسبة 8.6٪ منهم في قائمة خطوط الخلايا الخلافية. من ناحية أخرى ، 3.3 ٪ فقط من خطوط الخلايا في 634 ورقة التي تضم RRIDs كانت على قائمة إشكالية. هذا يشير إلى أن استخدام RRIDs مرتبط باستخدام أقل من خطوط الخلايا الإشكالية.

"لكن يجب أن نتوخى الحذر عند تفسير هذه النتائج" ، تشرح الكاتبة الكبيرة أنيتا باندرووسكي ، المدير التنفيذي ل SciCrunch و Lead Lead في مركز الأبحاث في الأنظمة البيولوجية ، جامعة كاليفورنيا ، سان دييغو. "لا يعني استخدام خطوط الخلايا الموجودة في قائمة المشاكل بشكل تلقائي أن سطرًا معينًا يتم استخدامه بشكل غير صحيح. بالإضافة إلى ذلك ، تتضمن القائمة خطوطًا خلوية تم تصنيفها بنوع خاطئ من السرطان ، ولكن قد لا تزال تستخدم بأمان في حالة يعرف الباحثون الهوية الحقيقية للخط ".

يضيف الفريق أنه من المهم مراجعة الأدلة التي تستند إليها النتائج وإصدار حكم مدروس بشأن تأثيرها على العمل المنشور. وخلص باندرووسكي إلى أن "موارد خط الخلية ، مثل Cellosaurus وسجل ICLAC لخطوط الخلايا التي تم تحديدها بشكل خاطئ ، قد تم تطويرها لتحسين الوعي بمعلومات الخلية". "نأمل أن يؤدي تضمين RRIDs إلى تحسين استخدام هذه الموارد وإعداد تقارير أفضل عن جميع المواد البحثية في المنشورات المستقبلية."

مصدر القصة:

المواد المقدمة من قبل خدمة eLife. ملاحظة: يمكن تعديل المحتوى للأسلوب والطول.